Les collemboles et les acariens forment la plus grande partie des microarthropodes des sols du monde. Ces êtres ubiquistes jouent un rôle essentiel dans la fragmentation de la litière des végétaux, dans le processus d’humification ainsi que dans le contrôle des populations animales et microbiennes des sols. C’est peu dire que ces organismes étaient méconnus jusqu’alors. Quelles espèces trouve-t-on aujourd’hui en Suisse ? Dans quelles proportions ? Voilà des questions auxquelles ce grand recensement a permis d’apporter un début d’éclairage. Au travers de prélèvements de carottes de sol sur 320 sites répartis à travers toute la Suisse, dans des biotopes d’importance nationale, des réserves forestières, mais aussi des alpages ou des terres cultivées, nous avons pu identifier à ce jour 314 espèces d’acariens et 167 espèces de collemboles. Mais ces chiffres augmentent à un rythme qui ne faiblit qu’à peine. Et parmi ces espèces, plusieurs semblent nouvelles pour la science. Des espèces, encore jamais observées, qui vivent sous nos pieds depuis des centaines de milliers d’années !

Ce projet a également permis d’implémenter une méthode d’estimation de la diversité des collemboles et acariens par l’ADN que ces animaux laissent dans le sol au cours de leur vie, puis à leur mort. Le metabarcoding est une technique qui amplifie les fragments d’ADN des groupes d’organismes recherchés, les séquence, puis les classe en unités taxonomiques. En établissant des “codes–barres” pour chaque espèce, il est alors possible d’associer un nom d’espèce à ces unités taxonomiques. A partir de l’ADN contenu simplement dans la terre, on peut alors déduire l’historique récent des espèces en présence sur un site. Les résultats que nous avons obtenus sont très encourageants pour intégrer cette technique dans les réseaux nationaux de mesure de biodiversité.